英国黑衣人总部王牌探员H与新晋探员M在阻止外星团伙入侵的过程中意外铲除了隐藏在黑衣人组织中的内奸，成功拯救世界 。各种脑洞大开的外星人和颠覆想象的高科技装备轮番登场，热血沸腾惊心动魄的动作追车场面层出不穷，完美构建出全新的黑衣人宇宙观。

故事发生在第一部的四年之后，此时特警K已经退休，成为一名普通的邮局局长，而J则继续从事MIB的工作。卡洛瑟星邪恶女王蛇莲娜来到地球需找宇宙能量“萨塔之星”，占领了MIB的总部。而当年逃亡到地球的萨塔公主萝娜曾请求MIB把 “萨塔之星”藏在地球，全面负责这件事情的K为了地球的安全，拒绝了她。面对来势汹汹的蛇莲娜，MIB派J去寻找k，调查当年事件的真相。

地球并不只是人类的天下，其实有1500名外星人生活中我们当中，而星际移民局则处理和外星人相关的事情。纽约普通警察爱德华兹因缘际会之下加入了这一组织，成为MIB的一员，代号J，从此没有名字、没有身份，成为特警K的搭档。J应对的第一起事件就是虫族的入侵。亚基伦王子罗斯伯在地球被虫族杀害，而他随身携带的“银河系”——宇宙次原子能源的最好来源也失踪了，若虫族找到，将给亚基伦人带来毁灭性的打击。

《名侦探柯南 Episode "ONE"变小的名侦探》对《名侦探柯南》动画第1集“云霄飞车杀人事件”进行了详细的描述。工藤新一是全国非常著名的高中生侦探，他与他的青梅竹马毛利兰一起在游乐园游玩的时候遭遇了案件，在解决该案件的过程中，工藤新一发现了两名行动诡异的黑衣男子，便决定跟踪他们一看究竟。但是不幸被黑衣男子发现，黑衣男子将他击晕后，给他灌下了一种名叫“APTX4869”的神秘毒药，在毒药的副作用下，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的天才发明家阿笠博士，博士为

6件大范围的连续杀人事件发生在东京周边的数个地区。警方除了目暮警部之外，还派了各县的警员增援，小五郎也参加了搜查会议。此时柯南却因为一个偶然的契机，发现一个警察从会议中离席，并乘上了一辆跑车离去。 “那辆车……居然，是琴酒！！” “黑衣人组织”中的一员居然潜入了搜查会议，琴酒肯定是想乘坐跑车逃走。连续杀人事件莫非是“黑衣人组织”做下的罪恶勾当？事态一触即发！！如果让琴酒知道工藤新一仍然活在这个世上，那么不止新一本人，只要和他扯上关系的朋友们都会被从这个世上抹杀掉。所以在明知危机四伏的情况下，柯南仍然开始单

6件大范围的连续杀人事件发生在东京周边的数个地区。警方除了目暮警部之外，还派了各县的警员增援，小五郎也参加了搜查会议。此时柯南却因为一个偶然的契机，发现一个警察从会议中离席，并乘上了一辆跑车离去。 “那辆车……居然，是琴酒！！” “黑衣人组织”中的一员居然潜入了搜查会议，琴酒肯定是想乘坐跑车逃走。连续杀人事件莫非是“黑衣人组织”做下的罪恶勾当？事态一触即发！！如果让琴酒知道工藤新一仍然活在这个世上，那么不止新一本人，只要和他扯上关系的朋友们都会被从这个世上抹杀掉。所以在明知危机四伏的情况下，柯南仍然开始单

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大和国皇帝身体日渐衰弱，武州国蠢蠢欲动，各大阵营各怀鬼胎。太子宁潇继位之际，皇帝受小人唆使，逼迫宁潇与丞相林甫之女结婚，宁潇不从，设计逃婚。林甫随即派出黑衣人追杀，重伤的宁潇被医女白芷救下。性格冷僻的宁潇本不愿接受白芷的帮助，却抵不过白芷的热情，渐渐对白芷敞开心扉，两人间生出了不一样的情愫。宁潇暗中派手下查探黑衣人身份，另一边林甫也在派探子调查宁潇的下落。林甫有一义女若溪，是武州国的公主。林甫密件若溪，让其时刻监视武州国将军魏疏的势力情况。宁潇恢复后决定南下调查武州国通敌之事，白芷不愿与其分开，为保护白芷

五帝之一青帝封印青麟木，但封印不稳，每隔一段时间就会产生裂隙，狐族为了报答青帝恩德，自愿留下守护青麟木。黑帝封印解除后，瞳洸成长为一个娇俏的少女，她担负起姐姐的职责成为玄水教祭司，以前那个只会依赖别人的小女孩渐渐成长，变得坚强独立起来。而在玄水祭坛上，玄极从黑衣人身上发现了一股熟悉的气息，那气息和自己有着千丝万缕的联系，似乎是一位故人……黑衣人究竟会是谁？