故事讲述西元2002年，一颗完全由冰组成的小行星P-12与进行发生了碰撞，带走了部分金星大气层，散落的冰块再金星表面形成高酸性的海洋，彻底改变了金星的面貌。人类随后开始着手金星地球化的移民计划，建造了中和海水和分离氧气的工厂。西元2018年，第一批移民到达金星北大陆，金星纪年元年开始。随后的日子里殖民地逐渐形成两个大自治州——伊修塔尔和阿夫洛迪亚，两州之间不断为争夺金星的统治权而交战。

时为西元2205 年，政府为了对抗目的为干涉过去历史的“历史修正主义者”，决定将拥有刀剑唤醒力量的审神者，以及最强付丧神“刀剑男士”送往各个时代，展开各式各样守护历史的冒险战斗……而花丸将以“某个本丸”为舞台，描写生活于其中的刀剑男士们的日常生活物语！

于西元2205 年时，政府为了对抗目的为干涉过去历史的「历史修正主义者」，决定将拥有刀剑唤醒力量的审神者，以及最强付丧神「刀剑男士」们送往各个时代，展开各式各样守护历史的冒险战斗……而花丸将以某个本丸为舞台，描写生活于其中的刀剑男士们的日常生活物语！