达拉克帝国是一个完全只有男人的国家，而美洁尔则是个百分之百的女人国，两边长期以来就互相仇视、战火连连。渡海响是一名机械工，在达拉克帝国中属于地位卑微的三等国民阶级，但在第二季故事中却发现，原来他是从地球移民的第一世代13位的其中之一，第一季潜入“雷号舰”盗取“蛮型机”机器人只是为了面子，不料却碰上美洁尔女人国来袭而被卷入战争中，从此改变了他的命运……

从行星波利斯逃脱等待重返地球的空间盘龙号，自称“雷奥尼克斯猎人”的神秘男子侵入其中。同时，其他的宇宙人们也正暗中开始行动，ZAP SPACY的船员们被卷入战争。

为了彻底消灭义军同盟，帝国准备建造一座威力更大的“死星”。在从赫特人贾巴的宫殿救出被碳凝的汉·索洛（哈里森·福特饰）后，义军策划对建造中的第二颗“死星”发动突袭，试图干掉正在其上视察的皇帝帕尔帕廷（伊恩·麦克迪阿梅德饰）。

被称作奥特黑暗杀手的黑暗魔人，具有创造奥特战士的黑暗战士的能力。赛罗奥特曼和格丽乔奥特曼落入了黑暗杀手之手。 为了应对这场危机，泰罗奥特曼召集了“新世代英雄”，银河奥特曼、维克特利奥特曼、艾克斯奥特曼、欧布奥特曼、捷德奥特曼、罗索奥特曼、布鲁奥特曼，以及银河救援部队的利布特奥特曼作为辅助。 “新世代英雄”与“黑暗军团”之间的战斗将开始。

暗吉尔，埃塔格…过去的宿敌不断复苏！ 还有谜一样的邪恶奥特曼，黑暗艾克斯和黑暗捷德登场！