佩琳在旅途中父亲去世，她与母亲一边做着照相馆的生意，一边以父亲的故乡法国作为旅行目标。然而之后母亲在巴黎去世，佩琳变成孤独一人。辛苦旅行的结果，带着母亲的遗言去父亲的家，第一次见到爷爷比尔法兰的时候，得知他是很严厉的人，而且痛恨她的母亲。佩琳因此隐瞒真实身分，用假名在爷爷经营的棉线工厂工作。一开始她是推手推车的工作，再来是英文翻译的工作，英文翻译令佩琳被比尔法兰所认同，并要佩琳当他的秘书。她知道自己的父亲和爷爷为了母亲结婚而不合，也知道比尔法兰非常憎恨佩琳的母亲把自己的儿子爱德蒙抢走，让她很伤心。但是佩琳

故事发生在为了保护保护银河铁路而与アルフォート星团帝国激战后1年，新的威胁又向银河铁路迫近了。银河铁路的轨道上出现了原因不明的幻想空间，绝对不可能存在的街道、植被甚至还出现了美丽的大海……。连续的突发事件让银河铁路管理局陷入了前所未有的的恐慌。正在这时他们收到了从现在银河铁路已经不再停靠的的ヒーライズ星（别名：被遗忘时间的惑星）发来的微弱的求救信号。那是来自VIP银河超级特快999号的SOS求救信号。管理局立刻派出了守护银河铁路空间安全的铁路警备队，俗称SDF(SPACE DEFENSE FORCE)的精

德国纳粹把在欧洲抢掠所得的数万吨黄金藏在撒哈拉大沙漠一个秘密基地，伯爵急电Jackie，要其配合Ada赴非洲寻找这批黄金，费尽艰辛抵达大沙漠后，Jackie一行人意外发现了藏金基地，而就在此刻一个神秘大汉突然出现，一场生死博斗遂即展开。

让无数人倾心的名作《银河铁道999》在2003年放映的续集《银河铁道物语》所描写的隐藏在无限宇宙里的神秘，可以算得上是松本零士的集大成作品，它保留了《银河铁道999》的世界观，以高质量的映像来表现美丽的宇宙空间以及精密设计的列车。在《银河铁道物语》迎来感动的最终回的1年后，银河铁道管理局紧急来电，空间铁道警备队又下达了新的出动命令。——银河铁道无法阻止的行星、被改写的星辰记忆、被迫分离的父子。