暗黑路基艾尔在引发的暗黑火花战争中用拥有让所有生物陷入时间停歇的暗黑波动将所有的奥特曼，怪兽和宇宙人变成人偶，后在突然出现的奥特曼银河导致两败俱伤，双方因能力用尽而进入沉睡状态。 人偶变成流星降落到地球上，从外国回来的礼堂光命运般的被选中为奥特曼银河的继承者，同时暗黑路基艾尔正利用着人们心中的黑暗获得邪恶力量想要复活。礼堂光决定用银河火花的力量变身成奥特曼银河保护着大家。

主要讲述了10位奥特曼勇士将联手共同对抗宇宙新出现的威胁——基于未知原因猎杀奥特战士的超时空魔神艾塔鲁达之经历，且10位奥特曼将会合体成最强的奥特曼战士——银河胜利奥特曼！

银护正受雇于大祭司阿耶莎去保护她治下的至高星人，这是一个全身金色的外星种族。作为回报，阿耶莎将他们的囚犯星云送给了银河护卫队。然而关键时刻火箭浣熊玩起双面间谍的游戏，背地里窃走至高星的能量电池，导致阿耶莎发动全军追杀银河护卫队，英雄们在神秘人物伊戈的帮助下惊险逃生，而伊戈正是星爵的亲生父亲，于是星爵、卡魔拉与毁灭者就追随伊戈和他的伙伴螳螂前往他的家园。星爵渐渐意识到伊戈并不是他期待中的父亲模样，在勇度、星云与螳螂的帮助下，银河护卫队将一面抵挡阿耶莎的追杀，一面阻止伊戈实现他宣称的宿命大业。

宇宙发生了异变，新的强敌出现！许多不该出现的凶恶怪兽和外星人纷纷出现！有人在偷偷谋划一场巨大的阴谋，如今，阴谋渐渐浮出水面。众多奥特战士们联手，前来解开谜团的真相。

银河·奥特曼是圆谷特摄剧《银河奥特曼》中的主人公，是来自未来的奥特曼，平时将自身的人偶隐藏在银河火花里。当充满勇气的心与银河奥特曼相呼应时，主人公礼堂光即与银河奥特曼一体化，现出巨大化的身姿。自身也有意识，能脱离变身者的存在而活动。通常为了保护礼堂光，与实体化者分离。

达拉克帝国是一个完全只有男人的国家，而美洁尔则是个百分之百的女人国，两边长期以来就互相仇视、战火连连。渡海响是一名机械工，在达拉克帝国中属于地位卑微的三等国民阶级，但在第二季故事中却发现，原来他是从地球移民的第一世代13位的其中之一，第一季潜入“雷号舰”盗取“蛮型机”机器人只是为了面子，不料却碰上美洁尔女人国来袭而被卷入战争中，从此改变了他的命运……