警察唐飞偶遇劫犯张日东，意外产生车祸，致使高敏之女丧生。几年后，当高小姐的小女儿再遭绑架，唐飞为了赎罪，奋不顾身私自查案，反发现独行杀手张家辉牵连其内。

让无数人倾心的名作《银河铁道999》在2003年放映的续集《银河铁道物语》所描写的隐藏在无限宇宙里的神秘，可以算得上是松本零士的集大成作品，它保留了《银河铁道999》的世界观，以高质量的映像来表现美丽的宇宙空间以及精密设计的列车。在《银河铁道物语》迎来感动的最终回的1年后，银河铁道管理局紧急来电，空间铁道警备队又下达了新的出动命令。——银河铁道无法阻止的行星、被改写的星辰记忆、被迫分离的父子。