三轮元年幼时遇到过一个非常善良的老师，因此毕生的志愿就是成为一名和他一样的老师。师范毕业之后，三轮元被派往偏僻的乡村小学就职，那里的孩子们自幼出生在贫困的家庭之中，问题多多，难缠的家长和冥顽不灵的学校领导让三轮元四面楚歌，焦头烂额。尽管情势十分的不乐观，但三轮元仍旧没有放弃希望，他发起了“萤火虫饲养计划”，希望能够通过这一举动加深师生之间的羁绊。琪琪从小生活在破碎的家庭之中，性格十分的孤僻冷漠，但是她却相信，只要能够放飞萤火虫，就能够重新获得失去的母爱。

与前两部作品不同，这次的故事发生在都市（兽人屋）。娜美越狱后，投靠了一名妓女。她被当地黑帮的情妇胜处以私刑。娜美为了追寻夜行女人们的“怨念”，拿起了一把刀……

　　匹里卡星的政权遭到了独裁将军吉尔莫亚（八名信夫 配音）发动的政变，大总统帕比（潘惠子 配音）被迫从匹里卡星逃了出来，误打误撞中降落到了地球。此时，大雄（小原乃梨子 配音）等人正在拍摄电影《宇宙小战

　匹里卡星的政权遭到了独裁将军吉尔莫亚（八名信夫 配音）发动的政变，大总统帕比（潘惠子 配音）被迫从匹里卡星逃了出来，误打误撞中降落到了地球。此时，大雄（小原乃梨子 配音）等人正在拍摄电影《宇宙小战争